Secuencian das Genom von Naegleria

Die Folge des Genoms von Naegleria hilft beim Verstehen, wie der erste Eucariota war, das minimale Genom mit Randbemerkungen zu versehen und metabolische exotische Wege zu analysieren, die außerdem vielleicht von Energiequellen dienen können.

Naegleria in gegeißelter Phase. Quelle: Lillian Fritz-Laylin, UC Berkeley.

Die wissenschaftliche Wichtigkeit einer Entdeckung oder seine Wichtigkeit stimmen sie mediática manchmal nicht überein. Die Entdeckung des neuen Fossils des Dinosauriers, hat gewissen Aufschlag mit oder ohne Federn, gewöhnlich mediático. Aber die Dinosaurier, sind So film-sie, unsere biologischen Ahnen nicht, sie müssten so viel Wichtigkeit nicht haben, obwohl sie unsere Einbildung aufregen. Sogar die Tierwelt von Burguess Shale, mit seinen seltsamen Kreaturen, bedeuten nicht sie gewöhnlich viel, obwohl sie von der großartigen Prosa von Steven J erzählt ist. Gould. Deshalb sprechen wir, wenn wir uns noch mehr nach hinten in der Zeit emporschwingen, und von Mikroben, es ist normal, dass die Leute mit wenigen Unruhen am Thema in Frage gehen.
Aber die Mikroben sind die Könige der Schöpfung. Es waren Bewohner dieses Planeten einzige während der Tausende von Millionen von Jahren und, noch heutzutage, wäre das Leben in der Erde ohne sie unmöglich. Ungefähr Attachés der affektierten Mikroben. In jeder Zelle unseres Körpers erleben sie immer noch in endosimbiosis die Mitocondrias, einige entartete Bakterien, die uns Energie anpassen. Sogar, nicht kennend, ist er, Sie, lesender Freund gemacht, er hat 10 Bakterien in seinem Körper durch jede Zelle somática.
Die Geschichte des Lebens ist eine Geschichte macht, mit einzigen Ereignissen los, basische Ereignisse, die sie für immer getauscht haben. Eine dieser Übergänge war der Schritt der Zellen procariotas ohne Kern, als die Bakterien und du wölbst, in Zellen eucariotas Kern-. Man glaubt, dass dieses Ereignis etwa 1500 Millionen von Jahren geschehen ist. Fast wir haben keine versteinerten Reste jener Zeit, so dass wir sie uns ersinnen sollen um zu untersuchen, dass er gegangen ist. Eine der Arten besteht darin, in Genomen der unterschiedlichen Arten zu sehen. In diesen genetischen Büchern ist Bericht der dieser Geschichte erzählt, wenn wir eine Übung "der verglichenen Literatur" machen. Das ist eine der Gründe, durch die Sequenzen Organismen: Um mehr auf der Vergangenheit zu wissen.
Einer der Genome ist neulich secuenciado dieser von Naegleria gruberi. Diese Kreatur ist vom biologischen Standpunkt ziemlich eigentümlich und sein Genom kann uns helfen den Übergang von Procariotas in eucariotas zu verstehen.
Die Arbeit haben in Ende Wissenschaftler des Department of Energy Joint Genome Institute (JGI) der Universität von Berkeley und Fachleute der Universität von Lancaster im Vereinigten Königreich gebracht.
Naegleria ist eine gemeinsame Amöbe des Bodens, der sich auf der Jagd der Bakterien widmet. Die Exemplare haben sich secuenciados, in diesem Fall, vom Schlamm der Baumpflanzung der Eukalypten im Campus der Universität von Berkeley abgesondert. Wenn sich dieser Organismus unter Stress befindet, wachsen er Geißeln, die orgánulos ähnliche zwischen diesem der Samenfäden sind, und er fängt an auf der Suche nach besseren Gebieten zu schwimmen. Außerdem hat er eine dritte Identität; wenn sich die Bedingungen des Bodens sehr hart umdrehen, wird er damalige in eine harte Zyste umgebildet und wartet auf bessere Zeiten.
Nach Simon E. Prochnik, ist ein Prozess als dieser von in den gegeißelten ab einem Zustand ameboideo umgebildet sein, sehr selten.

Er mikrofotografiert durch elektronisches Mikroskop des Kehrens (linke Hand) der Phase der Zyste von Naegleria. In der rechten Phase ameboidea von derselben Mikrobe. Quelle: Lillian Fritz-Laylin, UC Berkeley.

Prochnik und seine Mitarbeiter haben aufgedeckt, dass dieser Organismus, logisch, Pakete des allen diesen "Persönlichkeiten" gewidmete Gens hat. Sein Genom enthält 15.727 Gen nichts weniger als Proteinkodierer, die das eine mit den 23.000 vergleichbare Nummer in Menschen ist.
Die Vernunft, durch die Naegleria so vieles Gen hat, ist seiner komplizierten Lebensweise zu verdanken. Die Mehrheit der Organismen hat weniges Gen unicelulares. Nach Prochnik muss sein Genom im Wesen ein so vielseitiger Organismus, die notwendige Information enthalten, um in der Vielfalt der Milieus zu überleben, in denen er es macht und unter unterschiedlichen Tonleitern des Stresses, die er unterworfen ist.
Diese Forscher haben das Genom von Naegleria mit dem Genom 16 eucariotas verglichen, die von den Pilzen in die Menschen gingen, durch Pflanzen und protozoos gehend. Im Wesen ein freier Organismus Nicht-Schmarotzer, der keinen Bericht seines Gens und Funktionen verloren hat, einen weiteren Vergleich erlaubt hat und erlaubt, mehr Proteine zu finden, die in den althergebrachten Eucariotas waren. Sie haben eine Gesamtheit von 4000 Gen identifiziert, die, nach diesen Wissenschaftlern, wahrscheinlich Bericht des primitivsten Genoms eucariota ist.
Die entgegengesetzte Nummer von Gen hat die Forscher überrascht, weil er in vorigen Vergleichen, die in Mikroben Schmarotzer einschloßen, einer unterlegenen Nummer gegangen ist, wahrscheinlich, deswegen, dass die Schmarotzer Bericht seiner Funktionen im Gen des Wesens abordnen, das sie beherbergt. Dieses Ergebnis kann, infolgedessen helfen, die minimale Nummer von Gen zu bestimmen, das ein unabhängiges Leben erlaubt.
Das ist die erste komparativ Genetik, die nicht nur Naegleria, sondern außerdem in Vertretern der sechs Gruppen von Eucariotas secuenciados, als chromalveolata, diatomeas, die verursachende Mikrobe der Malaria, Mikroben von roten Gezeiten, Amöben oder Schmarotzern als giardia einschließt.
Zwischen anderen interessanten Ergebnissen dieses Studiums ist er, dass er helfen kann Licht zu werfen, auf wie sich die Zellen bewegen, wie Zeichen einige an andere gesendet werden oder wie sie Nährstoffe umsetzen.
Naegleria gebraucht pseudópodos in seiner Phase ameboidea in seinen Verschiebungen, um Bakterien zu jagen, aber wenn das Essen verschwindet, entwickelt er Geißeln seit "die nichts" und gebraucht sie, um in besseren Gebieten des Jagdflugzeuges zu schwimmen. Aber die Pseudópodos und die Geißeln gebrauchen verschiedene Proteine für die Bewegung. Der erste gegründet in actina, der ein Gerüst im Innern der Zelle schafft. Der zweite ist auf den Tubulina gegründet. Wie dieser Organismus beide Systeme hat kann den Wissenschaftlern helfen den Ursprung dieses parallelen Systems während der Evolution der Eucariotas zu verstehen.
Wenn die Wissenschaftler Nahrungsknappheit Bevölkerung von Naegleria unterworfen haben, haben sie bestätigt, dass sich alle fast schnell in seiner gegeißelten Form veränderten, wovon die Änderung des Systems gegründet in actina in anderem von microtúbulos in der ganzen Bevölkerung hoch regelmäßig und synchronisiert ist.
Das Genom dieser Mikrobe entdeckt auch, wie er Energie erzeugt. Er kann Sauerstoff gebrauchen, um Nährstoffe als Traubenzucker oder fette Säuren, zu "verbrennen" oder, wenn es kein Sauerstoff gibt, andere Nährstoffe und metabolische Wege gebrauchen, Wasserstoff als Nebenprodukt erzeugend. Der letzte Mechanismus erlaubt ihm, den Hipoxia im morastigen Milieu zu überleben, wo er lebt. Einer dieser Fachleute sinnt nach, dass das vielleicht dienen kann, um Biokraftstoffe zu erzeugen, wenn es gelingt, gut den letzten metabolischen Weg zu verstehen.
Die Folge des Genoms von Naegleria ist noch ein Schritt. Die komparativ wird zwischen sich von mehr Genomen des Entwicklungsbaums der Eucariotas uns helfen die Evolution der komplizierteren Tiere zu verstehen und das Verstehen anzufangen, woher wir kommen. Weil die grundlegende Wissenschaft nur vorhat, auf die grundlegenden gewohnten Fragen zu antworten: Woher wir kommen?: was sind wir?: gehen adónde wir? … haben Diese Wissenschaftler beim Klären ein bisschen mehr geholfen, wie das der Tataratatara … taratabuelo microbiano von Ihnen war, lesender Geliebter.

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Quellen und Hinweise:
Pressebericht von UC Berkeley mit Video.
Artikel in Cell (Zusammenfassung).